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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

广西发布强寒潮防御警报，这几天出现最低气温******url:https://m.gmw.cn/2023-01/11/content_1303251909.htm,id:1303251909

　　1月11日12时，广西壮族自治区防汛抗旱指挥部办公室发布强寒潮防御警报。据气象预报，未来十天我区气温先升后降，1月14日前气温回升、有雾或回南潮湿天气；14—17日受强冷空气影响，全区有强降温、大风、高寒山区及桂北有冰冻天气，各地气温下降12～14℃、局地16℃以上，最低气温出现在16—17日。

　　11—13日，桂东和沿海的部分地区有中雨、局地大雨到暴雨，我区其他地区阴天大部有小雨；全区大部有雾或回南潮湿天气。最低气温：桂北10～14℃，桂南15～18℃。

　　14—17 日，广西自北向南出现寒潮天气，全区阴天大部有小雨，其中桂东北局地有中雨，高寒山区及桂北局地有冻雨、小雪、雨夹雪或冰冻；桂东和沿海地区有偏北风6～7级、阵风8～9级；最低气温：高寒山区零下6～零下1℃，桂东北0～4℃，其他地区4～7℃。

　　18—20 日，全区阴天到多云，高寒山区及桂东北局地有冰冻或霜冻。最低气温：高寒山区零下5～0℃，桂北 1～6℃，桂南6～10℃。

　　北部湾海面：11—12日，中雨，东北风转偏南风4～5级；13—14日，多云到阴天，偏南风4～5级；15—17日，多云到阴天有小雨，偏南风转偏北风逐渐加大到7～8级、阵风9～10级。18日，阴天，偏北风5～6级、阵风7级；19—20日，多云，偏北风6～7级、阵风8级。

　　南宁晚报·南宁宝客户端 记者 韦薇

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）